Máy lọc cần được chọn theo thể tích hồ, mật độ cá, lượng cây và kiểu layout. Hồ nhỏ có thể dùng lọc treo hoặc lọc thác. Hồ lớn nên ưu tiên lọc thùng để có không gian chứa vật liệu lọc tốt hơn.